Alternatīvā sajaukšana
Alternatīvā sazarošana ļauj DNS kodēt vairāk nekā vienu olbaltumvielu. Tā maina ziņneša RNS eksonu sastāvu.
Alternatīvās sazarošanas gadījumā transkripcijas procesā iegūtās premesenger RNS eksonus RNS sazarošanas laikā savieno dažādos veidos.
Tādējādi no viena un tā paša gēna tiek iegūtas dažādas nobriedušas ziņnešu RNS. Tās tiek tulkotas dažādos proteīnos. Tādējādi viens gēns var kodēt vairākus proteīnus.
Alternatīvā sazarošana ir normāla eikariontiem. Tā ievērojami palielina genoma kodējamo olbaltumvielu daudzveidību. Cilvēkam ~ 95 % multieksonisko gēnu ir alternatīvi sašūti.
Pastāv dažādi alternatīvās sazarošanas veidi: visizplatītākais ir eksonu izlaišana. Dažos apstākļos vai konkrētos audos eksonu var iekļaut mRNS, bet citos - izlaist no mRNS. Ir sazarošanas aktivatori, kas veicina konkrētas sazarošanas vietas izmantošanu, un sazarošanas represori, kas samazina konkrētas vietas izmantošanu. Tiek atklāti jauni alternatīvās sazarošanas veidi.
Nenormālas sazarošanas variācijas rodas slimību gadījumos. Daudzu cilvēka ģenētisko traucējumu cēlonis ir sazarošanas varianti. Nenormāli sazarošanas varianti var veicināt arī vēža attīstību. Ar nefunkcionējošiem sazarošanas produktiem parasti cīnās, izmantojot posttranskripcijas kvalitātes kontroli. Tas nozīmē, ka tos sasmalcina ar enzīmu palīdzību.
Alternatīvā sazarošana rada divas proteīna izoformas.
Dažādības avots
Alternatīvā sazarošana (dažādu eksonu rekombinācija) ir galvenais eikariontu ģenētiskās daudzveidības avots. Viens konkrēts Drosophila gēns (DSCAM) var tikt alternatīvi sajaukts 38 000 dažādās mRNS.
Jautājumi un atbildes
J: Kas ir alternatīvā savienošana?
A: Alternatīvā sazarošana ir process, kurā transkripcijas laikā iegūtās pirms mesenger RNS eksoni RNS sazarošanas laikā tiek savienoti dažādos veidos, kā rezultātā no viena un tā paša gēna tiek iegūtas dažādas nobriedušas mesenger RNS, kas tiek tulkotas dažādos proteīnos.
J: Cik izplatīta ir alternatīvā sazarošana?
A: Alternatīvā sazarošana ir normāla eikariontiem, un tā ievērojami palielina genoma kodējamo olbaltumvielu daudzveidību. Cilvēkiem aptuveni 95 % multieksonisko gēnu ir alternatīvi sazaroti.
J: Kādi ir daži alternatīvās sazarošanas veidi?
A: Visizplatītākais alternatīvās sazarošanas veids ir eksonu izlaišana, kad atkarībā no konkrētiem apstākļiem vai audiem mRNS var iekļaut vai izlaist kādu eksonu. Ir arī citi veidi, piemēram, sazarošanas aktivatori un represori, kas attiecīgi veicina vai samazina konkrētu vietu izmantošanu, kā arī tiek atklāti jauni veidi.
J: Kā patoloģiskas alternatīvās splicēšanas variācijas ietekmē veselību?
A.: Alternatīvās sazarošanas patoloģiskās variācijas var izraisīt ģenētiskus traucējumus un veicināt vēža attīstību. Nefunkcionējošus produktus, kas rodas šajā procesā, parasti apstrādā ar posttranskripcijas kvalitātes kontroli, kur tos sasmalcina ar fermentu palīdzību.
J: Kādus proteīnus var izveidot, izmantojot alternatīvo sazarošanu?
A: Alternatīvās sazarošanas rezultātā viens gēns var kodēt vairākus proteīnus, kas palielina genoma kodējamo proteīnu daudzveidību.
J: Kas notiek, ja alternatīvās splicēšanas rezultātā rodas nefunkcionējoši produkti?
A: Ja alternatīvās splicēšanas rezultātā rodas nefunkcionējoši produkti, ar tiem parasti tiek galā ar pēcpārrakstīšanās kvalitātes kontroli, kad tos sasmalcina ar fermentu palīdzību.
