Wellcome Sanger Institute — Genomikas un ģenētikas centrs pie Kembridžas
Wellcome Sanger Institute, iepriekš saukts par Sanger Centre un Wellcome Trust Sanger Institute, ir bezpeļņas britu genomikas un ģenētikas pētniecības institūts. To galvenokārt finansē Wellcome Trust. Institūta pamatmērķis ir saprast, kā ģenētiskā informācija ietekmē veselību un slimības, kā arī attīstīt un nodrošināt lielapjoma genomikas tehnoloģijas pētniecībai un sabiedrības veselības vajadzībām.
Vēsture un izveide
Institūts atrodas Wellcome Genome Campus netālu no Hinkstonas ciemata, netālu no Kembridžas. Šajā pilsētiņā atrodas arī Eiropas Bioinformātikas institūts. Tas tika izveidots 1992. gadā un nosaukts divkārtējā Nobela prēmijas laureāta Frederika Sangera vārdā. No pašiem pirmsākumiem institūts bija paredzēts kā liela mēroga DNS sekvencēšanas centrs, un tas bija viens no galvenajiem dalībniekiem Cilvēka genoma projektā un vēlāk sniedza lielu ieguldījumu cilvēka genoma "zelta standarta" sekvencē.
Pētījumu galvenās jomas
Kopš 2000. gada institūts ir paplašinājis savu misiju, lai plašāk pētītu ģenētikas lomu veselībā un slimībās. Šobrīd institūtā strādā aptuveni 900 darbinieku, un tā darbība koncentrējas četrās galvenajās pētniecības jomās:
- cilvēka ģenētika — ģenētisko faktoru izpēte, kas ietekmē iedzimtas un iegūtas slimības, lielas kohortas analīzes un klīniskās genomikas projekti;
- patogēnu ģenētika
- peļu un zebru ģenētika — modeļu organismu izmantošana slimību mehānismu izpētē un fenotipu anotācijā (tai skaitā sadarbība starptautiskos projektos par peļu fenotipēšanu);
- bioinformātika — datu apstrāde, uzglabāšana un analītiskie rīki, kas nepieciešami lielapjoma sekvencēšanas datu interpretācijai.
Tehnoloģijas, infrastruktūra un dati
Wellcome Sanger Institute ir aprīkots ar plašām sekvencēšanas un genotipēšanas platformām, augstas caurlaides datu apstrādes centriem, kā arī specializētām laboratorijām modelorganismu pētījumiem un funkcionalajai ģenētikai (piemēram, CRISPR ekrāni). Jau no institūta pirmsākumiem ir spēkā aktīva datu koplietošanas politika — liela daļa ģenētisko datu tiek ātri publicēta un depozīta veidā pieejama starptautiskajos repozitorijos.
Institūts regulāri sadarbojas ar tādām datu infrastruktūrām kā Eiropas NCBI/ENA un EGA, kā arī ar Kembridžas universitāti, NHS un daudzām starptautiskām konsorcijām. Piemēram, institūts sniedza būtisku ieguldījumu tādos plaša mēroga projektos kā Cilvēka genoma projekts, un vēlāk — dažādos populācijas un vēža genomikas projektos. Pandēmijas laikā Wellcome Sanger Institute bija viens no centrālajiem partneriem nacionālajā SARS‑CoV‑2 sekvencēšanas programmā (COG‑UK), nodrošinot milzīgu genomu skaitu ātrai uzraudzībai.
Sadarbība, ētika un datu pieejamība
Institūts uzsver sadarbību gan akadēmiskajā, gan klīniskajā jomā — daudz pētījumu tiek īstenoti kopā ar universitātēm, slimnīcām un farmācijas uzņēmumiem. Paralēli tam tiek pievērsta liela uzmanība ētiskajiem, juridiskajiem un sabiedriskajiem jautājumiem (ELSI), it īpaši attiecībā uz pacientu datu aizsardzību, piekļuvi un atļaujām datu izmantošanai. Dati parasti tiek dalīti atbilstoši starptautiskām standartprocedūrām, lai nodrošinātu pētniecības reproducējamību un sabiedrības uzticību.
Izglītība, apmācība un sabiedriskā iesaiste
Wellcome Sanger Institute aktīvi iesaistās zinātnes popularizēšanā, piedāvājot apmācības programmas doktorantiem, postdokiem un tehniskajam personālam, kā arī organizējot seminārus un publiskus pasākumus. Institūts bieži sadarbojas ar Wellcome Genome Campus partneriem, lai nodrošinātu plašākas iespējas datu analīzei, bioinformātikas apmācībai un starpdisciplinārai pētniecībai.
Noslēgumā
Wellcome Sanger Institute ir viens no pasaules vadošajiem genomikas centriem, kam raksturīga augsta tehnoloģiskā kapacitāte, spēcīga sadarbība un agrīna datu koplietošanas prakse. Tā pētījumi veicina sapratni par cilvēku slimībām, infekcijām un bioloģiskajiem mehānismiem, kā arī nodrošina rīkus un resursus, kuri palīdz pārvērst genomikas atklājumus klīniskā praksē.
Jautājumi un atbildes
J: Kas ir Wellcome Sanger institūts?
A: Wellcome Sanger Institute ir bezpeļņas britu genomikas un ģenētikas pētniecības institūts.
Q: Kas finansē Wellcome Sanger Institute?
A: Wellcome Sanger Institute galvenokārt finansē Wellcome Trust.
J: Kur atrodas Wellcome Sanger Institute?
A: Wellcome Sanger Institute atrodas Wellcome Genome Campus netālu no Hinkstonas ciemata, netālu no Kembridžas, un tas atrodas vienā pilsētiņā ar Eiropas Bioinformātikas institūtu.
J: Kura vārdā ir nosaukts institūts un kāpēc tas tika izveidots?
A: Institūts ir nosaukts divkārtējā Nobela prēmijas laureāta Frederika Sangera vārdā, un tas tika izveidots 1992. gadā kā liela mēroga DNS sekvencēšanas centrs.
J: Kāds bija institūta ieguldījums Cilvēka genoma projektā?
A: Institūts piedalījās Cilvēka genoma projektā un sniedza lielāko ieguldījumu cilvēka genoma zelta standarta sekvencē.
J: Kāda ir institūta pētniecības darbības joma kopš 2000. gada?
A.: Kopš 2000. gada Institūts ir paplašinājis savu misiju, lai izprastu "ģenētikas lomu veselībā un slimībās".
J: Kādas ir četras galvenās institūta pētniecības jomas?
A.: Četras galvenās pētniecības jomas, ar kurām nodarbojas Institūts, ir cilvēka ģenētika, patogēnu ģenētika, peļu un zebru ģenētika un bioinformātika.
