Carsonella ruddii
Candidatus Carsonella ruddii ir endosimbiotiska gamma proteobaktērija. Tai ir mazākais zināmais genoms no visām baktērijām.
Šī suga ir endosimbionts, kas ir sastopams visās floēmas sulām barojošo kukaiņu, kas pazīstami kā psilīdi, sugās. Endosimbionts atrodas specializētā struktūrā, ko sauc par bakteriomu.
2006. gadā tika atklāts viena Ca. C. ruddi tika sekvencēts RIKEN Japānā un Arizonas Universitātē. Genoms ir apaļa hromosoma ar 159 662 bāzes pāru, un tam ir augsts kodēšanas blīvums (97 %) ar daudziem pārklājošiem gēniem un samazinātu gēnu garumu. Paredzēto gēnu skaits bija 182, kas arī ir mazākais reģistrētais (NCBI-Genome). Šķiet, ka trūkst daudzu dzīvībai būtisku gēnu, kas liecina, ka suga varētu būt sasniegusi organellu statusu.
Salīdzinājumam - Mycoplasma genitalium, kuras genoms ir mazākais no visiem brīvībā dzīvojošiem organismiem, ir 521 gēns.
Jautājumi un atbildes
J: Kas ir Candidatus Carsonella ruddii?
A: Candidatus Carsonella ruddii ir endosimbiotiska gamma proteobaktērija, kas ir sastopama visās floēmas sulām barojošo kukaiņu, kas pazīstami kā psilīdi, sugās.
J: Kāds ir Candidatus Carsonella ruddii genoma lielums?
A: Candidatus Carsonella ruddii genoms ir mazākais zināmais jebkuras baktērijas genoms, un tā apaļā hromosoma sastāv no 159 662 bāzes pāru.
Jautājums: Cik gēnu varētu būt Candidatus Carsonella ruddii?
A: Candidatus Carsonella ruddii paredzamais gēnu skaits ir 182, kas ir mazākais reģistrētais (NCBI-Genome).
J: Kāds ir Candidatus Carsonella ruddii genoma kodēšanas blīvums?
A: Candidatus Carsonella ruddii genoma kodēšanas blīvums ir augsts - 97 %.
J: Kas ir bakterioms?
A: Bakterioms ir specializēta struktūra, kurā atrodas Candidatus Carsonella ruddii endosimbionti.
J: Kā trūkst Candidatus Carsonella ruddii genoma?
A: Šķiet, ka Candidatus Carsonella ruddii genomā trūkst daudzu dzīvībai būtisku gēnu, kas liecina, ka suga, iespējams, ir ieguvusi organellas statusu.
J: Kā Candidatus Carsonella ruddii genoms atšķiras no Mycoplasma genitalium genoma?
A: Mycoplasma genitalium genomā, kam ir mazākais genoms no visiem brīvībā dzīvojošiem organismiem, ir 521 gēns, kas ir ievērojami vairāk nekā Candidatus Carsonella ruddii paredzamo gēnu skaits.
