Ķīmiskā informātika
Ķīmiskā informātika (pazīstama arī kā ķīmiskā informātika un ķīmiskā informātika) ir liela apjoma ķīmiskās informācijas pētniecība. To galvenokārt veic ar datoru palīdzību. Šos rīkus izmanto farmācijas uzņēmumi, lai atklātu jaunas zāles.
Ķīmijas informātika izmanto datorzinātnes un informācijas tehnoloģijas, lai palīdzētu risināt ķīmijas problēmas. Ķīmijas informātika nodarbojas ar algoritmiem, datu bāzēm un informācijas sistēmām, tīmekļa tehnoloģijām, mākslīgo intelektu un soft computing, informācijas un skaitļošanas teoriju, programmatūras inženieriju, datu ieguvi, attēlu apstrādi, modelēšanu un simulāciju, signālu apstrādi, diskrēto matemātiku, vadības un sistēmu teoriju, shēmu teoriju un statistiku, lai radītu jaunas zināšanas par ķīmiju.
Vēsture
Terminu "ķīmijas informātika" 1998. gadā definēja F. K. Brauns:
Pamati
Ķīmijas informātika apvieno ķīmijas un datorzinātņu zinātnisko darba jomu. Ķīmisko informātiku var izmantot arī datu analīzei papīra, celulozes un krāsu rūpniecībā.
Izmanto
Uzglabāšana un izguve
Galvenais ķīmiskās informātikas pielietojums ir ar savienojumiem saistītas informācijas glabāšana. Šādas uzglabātās informācijas efektīva meklēšana ietver tēmas, kas datorzinātnē tiek aplūkotas kā datu ieguve un mašīnmācīšanās.
Failu formāti
Ķīmiskās struktūras datoros tiek attēlotas specializētos formātos, piemēram, uz XML balstītā ķīmiskajā iezīmēšanas valodā jeb SMILES. Daži formāti ir piemēroti vizuālai attēlošanai 2 vai 3 dimensijās, bet citi ir vairāk piemēroti fizikālo mijiedarbību izpētei, modelēšanai un docking pētījumiem.
Virtuālās bibliotēkas
Ķīmiskie dati var attiekties uz reālām vai virtuālām molekulām. Virtuālos savienojumus var izmantot, lai izpētītu ķīmisko telpu un prognozētu jaunus savienojumus ar vēlamajām īpašībām.
Nesen, izmantojot FOG (fragmentu optimizētas augšanas) algoritmu, tika ģenerētas virtuālās bibliotēkas ar savienojumu klasēm (zāles, dabas produkti, uz daudzveidību orientēti sintētiskie produkti).
Virtuālā pārbaude
Tā vietā, lai pārbaudītu reālas ķīmiskās vielas, virtuālā skrīninga laikā ar datora palīdzību pārbauda savienojumus, lai identificētu tos, kuriem varētu piemist vēlamās īpašības, piemēram, bioloģiskā aktivitāte pret noteiktu mērķi.
Kvantitatīvās struktūras un aktivitātes attiecības (QSAR)
Tas ir, lai prognozētu savienojumu aktivitāti, pamatojoties uz to struktūru. Šie pētījumi sasaista ķīmijas un ķīmometrijas metodes. Svarīgas ir arī ķīmijas ekspertu sistēmas. Tās atspoguļo daļu ķīmijas zināšanu datoros.
Jautājumi un atbildes
J: Kas ir hemoinformātika?
A: Ķīmiskā informātika ir liela apjoma ķīmiskās informācijas izpēte, izmantojot datorus.
J: Kādus rīkus galvenokārt izmanto ķīmijas informātikā?
A: Ķīmijas informātikā galvenokārt izmanto datorus.
J: Kāpēc ķīmijas informātika ir svarīga?
A: Ķīmijas informātika ir svarīga, jo to izmanto farmācijas uzņēmumi, lai atklātu jaunas zāles un palīdzētu risināt ķīmijas problēmas.
J: Ar ko nodarbojas ķīmijas informātika?
A: Ķīmijas informātika nodarbojas ar algoritmiem, datu bāzēm un informācijas sistēmām, tīmekļa tehnoloģijām, mākslīgo intelektu un mīksto skaitļošanu, informācijas un skaitļošanas teoriju, programmatūras inženieriju, datu ieguvi, attēlu apstrādi, modelēšanu un simulāciju, signālu apstrādi, diskrēto matemātiku, vadības un sistēmu teoriju, shēmu teoriju un statistiku.
J: Kā ķīmijas informātika rada jaunas zināšanas par ķīmiju?
A: Ķīmijas informātika rada jaunas zināšanas par ķīmiju, izmantojot datorzinātnes un informācijas tehnoloģijas, lai analizētu ķīmiskos datus un risinātu ar ķīmiju saistītas problēmas.
J: Kas ir ķīmijas informātika?
A: Ķīmiskā informātika ir cits ķīmijas informātikas nosaukums.
J: Kā ķīmijas informātika tiek izmantota jaunu zāļu atklāšanā?
A: Farmaceitiskie uzņēmumi izmanto ķīmijas informātiku, lai analizētu lielus ķīmisko datu apjomus un noteiktu likumsakarības, ko var izmantot jaunu zāļu izstrādē.
