Haplogrupa: definīcija, Y‑DNS un mitohondriālās DNS (mtDNS) izcelsme
Uzzini haplogrupu definīciju, Y‑DNS un mtDNS izcelsmi — kā tās atklāj senču ceļus, mutācijas un ģenētiskās populācijas, plus pārmantošanas īpatnības.
Haplogrupa ir atsevišķu hromosomu jeb atsevišķu DNS pavedienu grupa, kam ir kopīgs priekštečs. Tām visās versijās ir vienādas mutācijas.
Haplogrupas liecina par dziļu senču izcelsmi tūkstošiem gadu senā pagātnē.
Cilvēka ģenētikā parasti tiek pētītas Y haplosomu (Y DNS) haplosgrupas un mitohondriālās DNS (mtDNS) haplosgrupas. Abas var izmantot, lai noteiktu ģenētiskās populācijas. Y DNS tiek nodota tikai no tēva dēlam, bet mtDNS tiek nodota tikai no mātes bērniem. Ne viena, ne otra nekombinējas, tāpēc Y DNS un mtDNS mainās tikai nejaušu mutāciju rezultātā, vecāku ģenētiskajam materiālam nesajaucoties.
Kas tieši definē haplogrupu?
Haplogrupa tiek noteikta pēc kopīgām iedzimtām mutācijām, parasti pēc viena nukleotīda polimorfisma (SNP), kas parādās visiem grupas locekļiem un trūkst ārpus tās. Šīs mutācijas darbojas kā "filiāles zīmes" — ja diviem indivīdiem ir vienas un tās pašas atvasinātās mutācijas, viņi, visticamāk, cēlušies no kopīga priekšteča. Ar laiku jaunas mutācijas veido apakšgrupas (subklādes), kas precizē izcelsmes stāstu.
Y‑DNS (vīrieša līnija) un mtDNS (mātes līnija)
- Y‑DNS: atrodas Y hromosomā un tiek nodota gandrīz nemainīta no tēva dēlam. Tā aptver tikai vienu ģenētisko līniju — tiešo vīriešu pirmkodu. Y‑DNS analīze bieži izmanto gan SNP, gan STR (īsu atkārtotu secību) testus, lai noteiktu haplogrupu un tuvāku radniecību.
- mtDNS: atrodas mitohondrijos un tiek nodota no mātes visiem viņas bērniem, bet no bērniem tā tālāk tiek nodota tikai meitām. mtDNS analīze sniedz informāciju par tiešo mātīgo līniju un bieži tiek izmantota paleogenētikā un populāciju izcelsmes pētījumos.
Kā haplogrupas tiek noteiktas un nosauktas
Laboratorijas nosaka haplogrupu, meklējot noteiktus SNP vai salīdzinot STR profilus ar zināmu haplogrupu pazīmēm. Nomenklatūra var būt sarežģīta — haplogrupei parasti piešķir burtu un ciparu kombināciju, kas atspoguļo filiālisku koku (piem., Y‑DNA R1b, E1b1a; mtDNA H, U, L). Pastāv starptautiskas datubāzes un koki (piem., ISOGG, PhyloTree), kas regulāri atjaunina haplogrupu klasifikāciju, jo ar jauniem SNP tiek atklātas jaunas atzarojuma vietas.
Kur un kāpēc haplogrupas tiek izmantotas
- Ģenētiskā antropoloģija un populāciju vēsture: palīdz atklāt migrācijas ceļus un senču sadalījumu reģionos.
- Arheogenētika (senās DNS): salīdzinot seno un mūsdienu paraugus, var rekonstruēt vēsturiskus iedzīvotāju pārvietojumus.
- Ģimenes vēsture un personīgā izcelsme: komerciālie anlitiskie testi var sniegt informāciju par tiešajām mātes vai tēva līnijām.
- Forensika un tiesu medicīna: dažkārt izmanto, ja nepieciešams sekot specifiskai līnijai vai identificēt paliekas.
Ierobežojumi un ko haplogrupa neparāda
Lai gan haplogrupas sniedz noderīgu informāciju par tālu izcelsmi, tās attiecas tikai uz vienu no daudzajām ģimenes līnijām (vai nu tikai tēva vai tikai mātes līniju). Tās nenorāda uz visu cilvēka ģenētisko mantojumu vai uz konkrētu etnisko piederību, un nebūt nevisina vispārēju ģimenes koku. Tāpat laika izmēri (cik tālu atpakaļ) ir aptuveni — tiek izmantoti modeļi un mutāciju ātrumi, kas rada neprecizitāti.
Piemēri
Dažas labi zināmas Y‑DNS haplogrupas: R1b (plaši sastopama Rietumeiropā), I (Ziemeļrietumeiropā), E (plaši Āfrikā un Vidusjūras reģionā). Biežas mtDNS haplogrupas: H (Eiropā), U (Eirāzijā), L (Īpaši Āfrikā). Šie piemēri ilustrē tendences, bet katrā reģionā ir liela daudzveidība un izņēmumi.
Kopsavilkums
Haplogrupa ir noderīgs rīks, lai izprastu tālas ģenētiskās līnijas un populāciju vēsturi. Analīze balstās uz kopīgām mutācijām un palīdz rekonstruēt priekšteču ceļus, taču tai jāpieiet kopā ar citām ģenētiskām un vēsturiskiem datiem, lai iegūtu pilnīgāku ainu par cilvēku izcelsmi.
Priekšteču haplogrupa A haplogrupa (Hg A) B haplogrupa (Hg B) Visas šīs molekulas ir daļa no priekšteču haplogrupas. Kādā brīdī senču molekulā, A mutācijā, notika mutācija, kas radīja jaunu līniju. Tā ir haplogrupa A, ko nosaka mutācija A. Vēlāk personai, kas ir haplogrupas A nesējs, radās jauna mutācija - mutācija B. Mutācija B nosaka haplogrupu B. Haplogrupa B ir haplogrupas A apakšgrupa. Gan haplogrupa A, gan B ir senču haplogrupas apakšgrupas.
Saistītās lapas
Jautājumi un atbildes
J: Kas ir haplogrupa?
A: Haplogrupa ir atsevišķu hromosomu vai DNS pavedienu grupa, kam ir kopīgs priekštečs un kam visās versijās ir vienādas mutācijas.
Q: Cik tālu atpakaļ var datēt haplogrupu dziļo senču izcelsmi?
A.: Haplogrupu dziļā senču izcelsme var būt tūkstošiem gadu senā pagātnē.
J: Kādas ģenētiskās populācijas var noteikt pēc haplosgrupām?
A: Ģenētisko populāciju noteikšanai var izmantot Y haplosomu (Y DNS) haplosgrupas un mitohondriālās DNS (mtDNS) haplosgrupas.
K: Kāda ir atšķirība starp Y DNS un mtDNS mantojuma ziņā?
A: Y DNS tiek nodota tikai no tēva dēlam, bet mtDNS tiek nodota tikai no mātes bērniem.
J: Vai Y-DNS un mtDNS rekombinējas?
A: Nē, Y-DNS un mtDNS nerekombinējas.
J: Kā mainās Y-DNS un mtDNS?
A: Y-DNS un mtDNS mainās nejaušu mutāciju rezultātā, vecāku ģenētiskajam materiālam nesajaucoties.
J: Kāpēc cilvēka ģenētikā tiek pētītas gan Y-DNS, gan mtDNS haplogrupas?
A: Y-DNS un mtDNS haplogrupas tiek pētītas cilvēka ģenētikā, jo tās var izmantot, lai noteiktu ģenētiskās populācijas un parādītu tūkstošiem gadu senu senas senču saknes.
Meklēt