RuBisCO — ribulozes-1,5-bisfosfātkarboksilāze: oglekļa fiksācijas enzīms
RuBisCO — oglekļa fiksācijas centrālais enzīms: kā tas piesaista CO2, nodrošina biosfēru un kā genetiķi cenšas uzlabot tā efektivitāti.
Ribulozes-1,5-bisfosfātkarboksilāzes oksigenāze, plašāk pazīstama kā RuBisCO, ir enzīms, kas katalizē Kalvina cikla pirmo svarīgāko oglekļa piesaistes soli. Oglekļa saistīšana ir process, kurā atmosfēras oglekļa dioksīda atomi tiek padarīti pieejami organismiem ar enerģiju bagātu molekulu, piemēram, glikozes, veidā. RuBisCO sadala 6-C molekulas divās vienādās daļās.
RuBisCO ir ļoti svarīgs bioloģijā un ekoloģijā, jo tas katalizē primāro ķīmisko reakciju, kuras rezultātā neorganiskais ogleklis pastāvīgi nonāk biosfērā.
RuBisCO ir arī visizplatītākais proteīns lapās un visizplatītākais proteīns uz Zemes. Tas veido 50 % no šķīstošajām lapu olbaltumvielām (20–30 % no kopējā lapu slāpekļa) un 30 % no augos šķīstošajām lapu olbaltumvielām (5–9 % no kopējā lapu slāpekļa).
Ņemot vērā tās svarīgo lomu biosfērā, pašlaik tiek mēģināts ģenētiski modificēt kultūraugus, lai tie saturētu efektīvāku RuBisCO.
Kā RuBisCO darbojas
Substrāts: RuBisCO katalizē reakciju starp ribulozes-1,5-bisfosfātu (RuBP) un CO2. Pamatreakcija ir RuBP + CO2 → 2 × 3‑fosfoglicerāts (3‑PGA). Šī 3‑C savienojuma tālākā pārstrāde Kalvina ciklā ļauj veidot ogļhidrātus.
Oksigenāzes aktivitāte: RuBisCO spēj reaģēt ne tikai ar CO2, bet arī ar O2. Šī alternatīvā reakcija (RuBP + O2 → 3‑PGA + 2‑fosfoglikolāts) saucas fotorespirācija un ir mazāk efektīva, jo daļa oglekļa tiek zaudēta un nepieciešama papildu enerģija atjaunošanai.
Struktūra un varianti
RuBisCO struktūra atšķiras atkarībā no organismu grupas. Visizplatītākā forma (Form I) sastāv no astoņām lielajām (RbcL) un astoņām mazajām (RbcS) subvienībām (L8S8). Lielā subvienība satur katalītisko centru. Ir arī citas formas (piem., Form II, III), kas sastopamas baktērijās un Arheja pasaulē.
- Aktivācija: RuBisCO aktivējas, kad noteikti serīna/lizosīna atomi tiek karbamilēti ar CO2 un saistās Mg2+ joni; šo procesu kontrolē arī specifisks palīgproteīns — RuBisCO aktivāze, kas lietderīga enzymes atjaunošanai pēc neaktīvas konformācijas.
- Kinetika: RuBisCO darbojas salīdzinoši lēni (salīdzinot ar citiem fermentiem) un tam nav ļoti augsta specifiskuma starp CO2 un O2, tāpēc augiem bieži nepieciešams liels enzīma daudzums fotosintēzei nodrošināt.
Nozīme ekosistēmās un globālā ietekme
RuBisCO ir centrāls elements globālajā oglekļa ciklā: tas pārveido atmosfēras CO2 par organiskām vielām, kas baro pārtikas ķēdes pamatu un ietekmē oglekļa aizturi uz Zemes mēroga. Tā plašā izplatība un loma fotosintēzē nozīmē, ka mazākas izmaiņas šī enzīma efektivitātē var būtiski ietekmēt ražību un oglekļa plūsmu.
Izaicinājumi un biotehnoloģiskas iespējas
RuBisCO uzlabošana ir sarežģīts mērķis. Pamatgrūtības:
- kompromiss starp reakcijas ātrumu (turnover) un specifiskumu (preference pret CO2 pār O2),
- kompleksa daudzsubvienību uzbūve un nepieciešamība pēc specifiskiem asistējošiem proteīniem,
- šūnas metabolisma un stūru lokālo apstākļu (CO2 koncentrācija, temperatura) ietekme.
Studijas izmanto vairākus pieejas ceļus: ģenētiski mainīt pašas RuBisCO subvienības, pārvietot efektīvākas RuBisCO variācijas no mikroorganismiem uz augiem, vai ieviest oglekļa koncentrēšanas mehānismus (piemēram, karboksomi vai C4 ceļus). Daļa pētījumu izmanto arī ģenētisko modifikāciju un hibridizāciju, bet praktiskas, lauksaimniecībā izmantojamas izmaiņas vēl joprojām prasa laiku un rūpīgu testēšanu.
Īsais kopsavilkums
RuBisCO ir fotosintēzes centrālais enzīms, kurš piesaista atmosfēras CO2 un sāk organisko vielu sintēzi. Tas ir ļoti būtisks biosfērai un klimata procesiem, bet vienlaikus ierobežojošs faktors augiem, jo tā katalītiskā efektivitāte ir ierobežota. Zinātnes un biotehnoloģiju centieni mērķē uz šī enzīma optimizāciju, lai palielinātu lauksaimniecības ražību un oglekļa aizturi, tomēr panākumu ceļš ir sarežģīts un daudzpusīgs.
RuBisCO telpas aizpildījuma skats, kurā redzams lielo ķēžu (balta/pelēka) un mazo ķēžu (zila un oranža) izvietojums.
Jautājumi un atbildes
J: Kas ir RuBisCO?
A: RuBisCO ir enzīms, kas katalizē Kalvina cikla pirmo svarīgāko oglekļa piesaistes posmu.
J: Kāds ir oglekļa piesaistes process?
A: Oglekļa saistīšana ir process, kurā atmosfēras oglekļa dioksīda atomi tiek pārvērsti enerģētiski bagātās molekulās, piemēram, glikozē, ko var izmantot organismi.
J: Ko dara RuBisCO?
A: RuBisCO sadala 6-C molekulas divās vienādās daļās un katalizē primāro ķīmisko reakciju, kuras rezultātā neorganiskais ogleklis pastāvīgi nonāk biosfērā. Tas ir arī visizplatītākais proteīns uz Zemes.
J: Kāpēc RuBisCO ir svarīgs bioloģijā un ekoloģijā?
A: RuBisCO ir svarīgs bioloģijā un ekoloģijā, jo tas ir atbildīgs par atmosfēras oglekļa dioksīda primāro pārvēršanu organiskās molekulās, kas nodrošina dzīvību uz Zemes.
J: Cik izplatīts ir RuBisCO?
A: RuBisCO ir visizplatītākais proteīns uz Zemes, un tas veido 50 % no šķīstošajiem lapu proteīniem un 30 % no šķīstošajiem lapu proteīniem augos.
J: Kāpēc tiek mēģināts ģenētiski modificēt kultūraugus, lai tie saturētu efektīvāku RuBisCO?
A: Tiek veikti centieni ģenētiski modificēt kultūraugus, lai tie saturētu efektīvāku RuBisCO, jo tam ir svarīga loma atmosfēras oglekļa pārvēršanā kultūraugiem un citiem organismiem noderīgās organiskās molekulās.
J: Kāds ir pirmais svarīgākais oglekļa piesaistes posms Kalvina ciklā?
A: Pirmais svarīgākais oglekļa piesaistes posms Kalvina ciklā ir RuBisCO veikta oglekļa dioksīda katalīze.
Meklēt