Linkolna prezidentūra ilga aptuveni četrus gadus. Tā ilga no 1861. gada 4. marta līdz 1865. gada 15. aprīlim, kad viņu nošāva kāds konfederātu atbalstītājs un viņš nomira. Gandrīz visu viņa pilnvaru laiku aizņēma pilsoņu karš. No viņa ievēlēšanas Vēlētāju kolēģijā 15. februārī līdz inaugurācijai 4. martā Linkolnam bija maz laika, lai izveidotu kabinetu.
Linkolna kabinets
Linkolna kabinets bija unikāls Amerikas vēsturē. Tajā bija visi viņa galvenie konkurenti uz 1860. gada republikāņu nomināciju. Politiskajās sarunās, kas bija daļa no politiskajām sarunām pirms nominācijas, dažiem bija apsolīts amats ministru kabinetā. Tā nebija harmoniska grupa, jo lielākā daļa no viņiem viens otram nepatika. Viņiem bija atšķirīgas idejas par valsts vadību, atšķirīga ētika un atšķirīgas personības. Jo īpaši Saimonu Kameronu Linkolnam uzspieda vienošanās, kas tika noslēgta ar Pensilvānijas delegātiem republikāņu konventā. Viņš jau bija ieguvis nekompetenta un korumpēta cilvēka reputāciju. Saskaņā ar vienošanos viņš bija Linkolna kara ministrs.
Dalībnieku vidū bija:
- Hanibals Hamlins, Linkolna pirmais viceprezidents (1861-1865).
- Endrjū Džonsons, Linkolna otrais viceprezidents (1865-1865) un 17. ASV prezidents.
- Salmon P. Chase, ASV Valsts kases sekretārs. 1864. gadā viņš kļuva par Augstākās tiesas priekšsēdētāju.
- Saimons Kamerons, kara ministrs (1861-1862).
- Edvīns Stantons, kara ministrs (1862-1865).
- Viljams H. Sivords, valsts sekretārs (1861-1865).
- Gideons Velss, Jūras kara flotes sekretārs (1861-1865).
- Montgomerijs Blērs, pasta ģenerāldirektors (1861-1864).
- Edvards Batess, ģenerālprokurors (1861-1864).
Iekšlietas
Linkolna administrācijas uzdevums bija vadīt valsti cauri tās tumšākajām dienām. Viņš mantoja problēmas no sava priekšgājēja, prezidenta Džeimsa Bukanena. Savā inaugurācijas runā četrus gadus iepriekš Bukanans bija nosaucis verdzības jautājumus par "laimīgi maznozīmīgu praktisku jautājumu". Bukanens uzskatīja, ka viņam nav pilnvaru kaut ko darīt gaidāmā pilsoņu kara jautājumā. Viņš teica: Bukanens sacīja: "Nav neviena prezidenta spēkos, neatkarīgi no tā, kādas ir viņa politiskās ievirzes, atjaunot mieru un saskaņu starp štatiem. Viņš vienīgais, gudri ierobežojot un ierobežojot savas pilnvaras saskaņā ar mūsu konstitūciju un likumiem, var maz ko izdarīt ne par labu, ne par ļaunu šādā svarīgā jautājumā." Tuvojoties pilsoņu karam, Bukanena prezidentūras laikā valsts nonāca recesijā.
Tā vietā, lai ignorētu vai samierinātos ar situāciju, Linkolnam nācās labot salauzto valsti vai arī redzēt, kā tā tiek sagrauta. Starp prezidenta vēlēšanām un viņa inaugurāciju septiņi atdalījušies štati izveidoja Amerikas Konfederētās Valstis. To konstitūcija bija veidota pēc ASV konstitūcijas parauga ar četrām atšķirībām. Tā atbalstīja štatu suverenitāti. Tā garantēja, ka Konfederācijas štatos vienmēr pastāvēs verdzība. Tā neļāva Dienvidu Kongresam noteikt aizsargtarifus. Tā arī ierobežoja Konfederācijas štatu prezidenta pilnvaru termiņu līdz 6 gadiem. Par CSA prezidentu tika ievēlēts Džefersons Deiviss. Viņš bija Misisipi vergu īpašnieks, ASV senators un arī kara ministrs prezidenta Franklina Pīrsas laikā. CSA ieņēma vairākas filozofiskas nostājas, kas atšķīrās no ASV nostājām. Tā uzskatīja, ka Amerikas Savienotās Valstis ir tikai suverēnu pavalstu apvienība, kāda tās bija saskaņā ar Konfederācijas statūtiem pirms ASV konstitūcijas pieņemšanas. Viņi uzskatīja, ka katra pavalsts var brīvi izstāties no pavalstu apvienības. Ziemeļi uzskatīja Savienību par pastāvīgu valsti. Linkolns norādīja, ka katrs štats ir atteicies no savas suverenitātes, ratificējot un pieņemot Konstitūciju. Viņš arī apgalvoja, ka nevienam štatam nav tiesību sacelties pret savu valsti - Amerikas Savienotajām Valstīm. Taču Linkolns klusēja par CSA no tās izveidošanas līdz pat savai inaugurācijai. Viņš atkārtoja savu priekšvēlēšanu kampaņas solījumu, ka kā prezidents neveiks nekādus pasākumus, lai apturētu vai ierobežotu verdzību tajos štatos, kur tā jau pastāvēja. Tomēr viņš nepieņēma Miera komisijas priekšlikumus. Demonstrējot savus miermīlīgos nodomus, viņa inaugurācijas uzrunas mērķis bija novērst citu dienvidu štatu pievienošanos CSA. Tās nebija ienaidnieki. Viņš CSA neuzbruktu, bet saglabātu un uzturētu visu ASV valdības īpašumu, kas pastāvēja Dienvidu štatos.
Dienu pēc inaugurācijas Linkolns saņēma depešu no majora Roberta Andersona. Viņš bija Sumtera forta Čarlstonas ostā komandieris. Viņš informēja Linkolnu, ka, ja drīzumā netiks papildināts forta krājums, viņam un viņa vīriem būs jāatstāj cietoksnis. Linkolns izdomāja, kā papildināt fortu, nesākot kaujas. Viņš nosūtīs uz Sumtera fortu neapbruņotus apgādes kuģus. Viņš informēja CSA prezidentu Deivisu par saviem nodomiem. Šādā veidā ASV nesāktu kaujas, bet noturētu fortu, kā to bija solījis Linkolns. Deiviss nekavējoties nosūtīja ģenerāli P. G. T. Bodžardu, lai piespiestu fortu padoties, pirms apgādes kuģi varēja ierasties. 1861. gada 12. aprīlī pulksten 4:30 no rīta Konfederācijas lielgabali sāka bombardēt Sumtera fortu. Pēc 33 stundām majors Andersons nodeva fortu. Tas bija Pilsoņu kara sākums.
Karš ilga četrus gadus. Ziemeļi neparedzēja, ka Dienvidi cīnīsies gandrīz līdz pēdējam, lai aizstāvētu savu "brīvību". Dienvidi nenojauta, ka Linkolna vadītie Ziemeļi izrādīs dzelžainu gribu par katru cenu saglabāt Savienību.
Ārlietas
Viena no Linkolna militārajām stratēģijām bija bloķēt Dienvidu ostas un aptuveni 3500 jūdžu (5600 km) garu krasta līniju. Kara sākumā, kad bija tikai daži kuģi, tas bija gandrīz neiespējami. Līdz kara beigām Savienība bija sagūstījusi vai iznīcinājusi 1500 blokādes kuģu. Taču, tā kā gandrīz 5 no 6 veikaliem varēja izvairīties no blokādes, Lielbritānija apgalvoja, ka starptautiskās tiesības to neatzīst, jo tā bija "papīra blokāde". Konfederācija kara laikā varēja nosūtīt uz Angliju tikai nelielu daļu no savas galvenās ienesīgās produkcijas - kokvilnas. Trīs gadus pirms kara Dienvidi bija nosūtījuši 10 miljonus ķīpu kokvilnas gadā. Kara laikā tās nosūtīja tikai 500 000 ķīpu. Taču Anglijas ražotāji bija uzkrājuši lielu daudzumu Dienvidu kokvilnas no milzīgā eksporta pirms kara. Tas, kas viņiem bija krājumā, nodrošināja viņiem visu kara lielāko daļu.
1861. gadā gan Konfederācija, gan Savienība vēlējās Lielbritānijas palīdzību. Ziemeļi paļāvās uz Lielbritāniju, jo tā nosodīja verdzību. Konfederācija paļāvās uz to palīdzību, jo tās kokvilna bija ļoti svarīga Lielbritānijas ekonomikai. Tāpēc abām pusēm bija diplomātiskas attiecības ar Lielbritāniju. Dienvidiem bija vajadzīga Lielbritānijas palīdzība, lai uzvarētu karā. Bez Lielbritānijas palīdzības Francija arī neuzdrošinātos iejaukties, lai gan tā jau bija draudzīgi noskaņota pret Dienvidiem. 1861. gada 4. maijā karaliene Viktorija izdeva proklamāciju, ar kuru pasludināja Lielbritānijas neitralitāti karā un atzina Konfederāciju par konfliktā karojošo pusi. Tas sadusmoja Linkolnu. Viņa valsts sekretārs Sjūards jau bija izdevis instrukcijas jaunajam ministram Lielbritānijā, ka gadījumā, ja karaliene atzīs Konfederāciju, viņam jāaiziet un jāatgriežas mājās. Francija nāca klajā ar līdzīgu deklarāciju, kurā arī atzina CSA kā valsti. Sevards brīdināja abas valstis par iespējamu karu ar ASV šī jautājuma dēļ.
Lielbritānijas premjerministrs lords Palmerstons nosūtīja kara kuģu floti uz Atlantijas okeāna rietumu daļu, lai sagatavotos negaidītam uzbrukumam Ņujorkai. Viņi plānoja izmantot pasaulē lielāko kuģi SS Great Eastern kā karaspēka transportu. Viņi uzskatīja, ka trieciens pret Ņujorku būtu trieciens pret ASV tirdzniecības centru. Taču 1862. gada pavasarī briti uzzināja par Savienības dzelzsapvalka karakuģi USS Monitor. Tas atcēla jebkādus iebrukuma plānus. Lai gan britu flotei bija dzelzs kara kuģi, tiem kuģošanai bija nepieciešami dziļi ūdeņi. Monitor un tam līdzīgie Ziemeļu kuģi varēja iznīcināt britu kuģus, ja tie mēģinātu bloķēt Ziemeļu ostas. Krievija arī bažījās, ka briti un/vai franči varētu iejaukties. 1862. gada vasarā valstu koalīcija apsvēra iespēju iejaukties, lai starpniekotu karā. To vidū bija Lielbritānija, Francija, Prūsija, Austrija un Krievija. Taču 1863. gada rudenī Krievijas cars Aleksandrs II nosūtīja savu jūras kara floti, lai aizsargātu Amerikas Savienotās Valstis no Lielbritānijas un Francijas iebrukuma. Baltijas flote sāka iebraukt Ņujorkas ostā 1863. gada 24. septembrī. Krievijas Tālo Austrumu flote tika nosūtīta uz Sanfrancisko.
Līdz kara beigām lielākajai daļai Eiropas valstu bija maz ieguvumu no Konfederācijas atzīšanas par suverēnu valsti. Linkolns diplomātiski izturējās pret diviem konfederātiem, kas tika arestēti uz britu kuģa "Trent". Viņš lika abus atbrīvot. Ražas trūkums Eiropā padarīja populārus Savienības lauksaimniecības produktus. Ēģipte un Indija varēja piegādāt kokvilnu, kas pirms kara tika iepirkta no Dienvidiem. Savienība bija arī labs pircējs kājnieku ieročiem un citām rūpniecības precēm no Eiropas. Tomēr kara laikā Anglijas kuģu būvētāji konfederātu flotei uzbūvēja desmitiem blokādes kuģu un karakuģu.